“繼‘人類基因組計劃’后,‘人類表型組計劃’成為生命科學(xué)領(lǐng)域又一戰(zhàn)略制高點?!祟惐硇徒M計劃’的開展,將全面解讀人類生命密碼所需的關(guān)鍵信息?!敝袊茖W(xué)院院士、“國際人類表型組計劃(一期)”項目首席科學(xué)家、復(fù)旦大學(xué)副校長金力說,“人類表型組計劃”將系統(tǒng)解答基因與表型之間的具體關(guān)系和內(nèi)在機制,將有助于實現(xiàn)疾病預(yù)防,并提出針對性的健康維護方案。
近日,“國際人類表型組計劃(一期)”項目在上海啟動。該項目是上海首批市級科技重大專項,也是上海建設(shè)具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心的重要舉措,由復(fù)旦大學(xué)牽頭,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院、上海交通大學(xué)等單位專家共同承擔(dān),國內(nèi)外百余名科學(xué)家投身其中。
相比于人們熟知的基因,表型顯得比較陌生。那么,表型研究對于人類意義幾何?基因和表型是什么關(guān)系?中國是否具備組織發(fā)起“人類表型組”國際大科學(xué)計劃的能力,我們的自信和底氣來自于哪里?記者請項目一期首席科學(xué)家金力院士答疑解惑。
構(gòu)建健康人群表型圖譜及數(shù)據(jù)庫
2001年“人類基因組計劃”完成后,生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)研究進入“后基因組時代”。對于高度濃縮的基因信息如何演化為最終復(fù)雜表現(xiàn)形式(即表型),目前科學(xué)家們正在積極探究。
那么,何為表型?“指生物體從胚胎發(fā)育到出生、成長、衰老甚至死亡過程中,由基因與環(huán)境以及二者互作產(chǎn)生的形態(tài)特征、功能、行為、分子組成規(guī)律等生物學(xué)性狀的具體表現(xiàn)?!苯鹆φf,“人類表型組是人體中除了基因組外的另一半生命密碼,其研究被《自然》雜志評為新方向,發(fā)展前景非常光明,在醫(yī)療健康領(lǐng)域?qū)l(fā)揮‘點石成金’的作用。”
“人類基因組計劃”破解了人體基因“天書”,但疾病不僅僅由基因單一因素導(dǎo)致?!皣H人類表型組計劃(一期)”將通過對人類表型組在物理、化學(xué)和生物層面進行跨尺度多維度研究,首次建立國際人類表型組學(xué)研究平臺,全面制定我國人群健康表型組標準化技術(shù)體系,構(gòu)建中國首例健康人群表型圖譜及數(shù)據(jù)庫。
現(xiàn)實的情況是,由于成本較高、采樣要求嚴格、標準尚未統(tǒng)一等原因,人類表型組學(xué)研究目前處于各自為營、逐步積累的階段。為了改變這一局面,組織“人類表型組計劃”已在科研團體中醞釀。
“特有的人群遺傳結(jié)構(gòu)與環(huán)境因素,共同塑造了每個人獨特的表型特征,這造就了豐富的表型特征多樣性?!苯鹆φf,由于表型組學(xué)自身的多樣性和復(fù)雜性,建立全方位、多功能的表型組學(xué)測量和分析技術(shù)體系顯得尤為重要。
中國工程院院士、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院校長王辰表示,中國人群基數(shù)大、樣本多、表型廣,建立健康人群的表型數(shù)據(jù)測量標準及技術(shù)體系,對精準醫(yī)學(xué)發(fā)展意義重大。
相關(guān)人才和技術(shù)已有儲備
大量表型組數(shù)據(jù)的獲得、標準化、整合及“歸因”分析,是解析單基因遺傳疾病,甚至復(fù)雜疾病致病原因的關(guān)鍵。
“‘國際人類表型組計劃(一期)’得到上海市市級科技重大專項批準支持,但還不是真正意義上的國際大科學(xué)計劃。當(dāng)然,我們已具備了實力和基礎(chǔ),有望通過進一步努力,組織發(fā)起‘人類表型組’國際大科學(xué)計劃?!苯鹆φf,復(fù)旦大學(xué)10年前就在泰州建立了20萬人的大型健康人群隊列并持續(xù)跟蹤研究,建立了系列人類表型測量方法,獲得了大量人群體質(zhì)表型測量數(shù)據(jù),發(fā)展了國際領(lǐng)先的高通量、高靈敏、高特異分子表型檢測技術(shù),研發(fā)了全表型譜數(shù)據(jù)整合與分析技術(shù)。
無論從關(guān)鍵技術(shù)、數(shù)據(jù)收集,還是高端人才、組織經(jīng)驗來說,都為中國組織發(fā)起“人類表型組”國際大科學(xué)計劃構(gòu)建支撐平臺。
“我們擁有一支卓越的、多學(xué)科交叉的人類遺傳學(xué)和表型組研究團隊,并吸引了一批國外著名專家參與,包括‘代謝組學(xué)之父’英國醫(yī)學(xué)科學(xué)院院士杰里米·尼科爾森?!苯鹆Ω嬖V科技日報記者,國內(nèi)的協(xié)同網(wǎng)絡(luò)也已構(gòu)建,集聚了20余家國內(nèi)優(yōu)勢單位的60多名院士、杰青、長江等高端人才;并與7個國家14家著名的研究機構(gòu)的專家進行溝通,基本完成國際布局的前期協(xié)調(diào)工作。
值得關(guān)注的是,金力曾任國際人類基因組組織委員,為組織國際大科學(xué)計劃積累了豐富的經(jīng)驗。作為國際人類基因組計劃參與者和國際人類單倍型計劃的推動者,他還參與了美國國家健康研究院“后基因組時代”戰(zhàn)略路線圖的制定等。
牽頭國際大科學(xué)計劃尚需“內(nèi)外兼修”
“我們初步設(shè)計了大科學(xué)計劃的實施機制,確定了‘分布式’國際大科學(xué)計劃模式,統(tǒng)一技術(shù)標準并且共享數(shù)據(jù)資源?!苯鹆φf,國際人類表型組研究的順利開展,還得益于從上海到國家的政策支持。早在2015年,復(fù)旦大學(xué)承擔(dān)科技部先發(fā)布局的“中國各民族體質(zhì)人類學(xué)表型特征調(diào)查”國家科技基礎(chǔ)性工作專項項目,構(gòu)建系統(tǒng)反映中華民族從個體到群體表型多樣性的數(shù)據(jù)庫和數(shù)字化樣本庫。
2016年4月,國務(wù)院批準《上海系統(tǒng)推進全面創(chuàng)新改革試驗 加快建設(shè)具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心方案》中,“國際人類表型組”被列入需布局的重大科學(xué)基礎(chǔ)工程;2016年8月,上海市科技創(chuàng)新“十三五”規(guī)劃將“國際人類表型組”列為推進原始創(chuàng)新重大突破的戰(zhàn)略方向。
開展人類表型組研究已成為學(xué)術(shù)界的共識。杰里米·尼科爾森公開表示,人類表型組研究不僅需要集成多學(xué)科的優(yōu)勢力量,更需要全球科學(xué)家的大協(xié)同。該專項有望將人類表型組研究打造成為國際性科研高地,助推中國生命科學(xué)走向世界領(lǐng)軍地位。
前不久,國務(wù)院印發(fā)《積極牽頭組織國際大科學(xué)計劃和大科學(xué)工程方案》(以下簡稱《方案》),意在為解決世界性重大科學(xué)難題貢獻中國智慧、提出中國方案、發(fā)出中國聲音。
制定戰(zhàn)略規(guī)劃、確定優(yōu)先領(lǐng)域,成為《方案》的重點任務(wù)之一,將圍繞物質(zhì)科學(xué)、宇宙演化、生命起源、地球系統(tǒng)、環(huán)境和氣候變化、健康等多學(xué)科交叉領(lǐng)域的優(yōu)先方向、潛在項目等,制定發(fā)展路線圖。
“掌握了關(guān)鍵技術(shù)、豐富的組織經(jīng)驗、高素質(zhì)的人才隊伍,但國際人類表型組計劃‘成長’為真正的國際大科學(xué)計劃,依然離不開國家層面的支持?!苯鹆ν嘎?,“國際人類表型組計劃(一期)”得到上海市政府近5.6億元資助,系統(tǒng)的表型測量工作將于今年7月正式啟動。至于全球行動,則將通過國際合作項目來推動,目標就是組織發(fā)起“人類表型組”國際大科學(xué)計劃。
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